All’interno della comunità degli analisti transazionali talvolta vengono espresse posizioni anti-diagnostiche. Ogni terapeuta sviluppa una propria concezione della diagnosi ripercorrendo, probabilmente, lo sviluppo percorso dal campo della psicoterapia nel suo complesso, in modo analogo a come l’ontogenesi ripercorre la filogenesi. Storicamente si è osservato il passaggio da posizioni antidiagnostiche a posizioni critiche costruttive. È avanzata l’ipotesi che, essendo la diagnosi una componente ineludibile del ragionamento clinico, le posizioni antidiagnostiche riflettano una confusione tra i diversi livelli ai quali si può sviluppare il ragionamento clinico (informale, formale e istituzionale) ed i diversi professionisti ai quali si rivolgono i sistemi diagnostici (scuola-specifico, famiglia-specifico, sistema sanitario generale).